Dihydrospingosine

AlkaPlorer ID: AK003328

Synonym: None

IUPAC Name: (2S,3R)-2-aminooctadecane-1,3-diol

Structure

SMILES: CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO

copy

InChI: InChI=1S/C18H39NO2/c1-2-3-4-5-6-7-8-9-10-11-12-13-14-15-18(21)17(19)16-20/h17-18,20-21H,2-16,19H2,1H3/t17-,18+/m0/s1

copy

InChIKey: OTKJDMGTUTTYMP-ZWKOTPCHSA-N

copy

Properties Information

Molecule Weight: 301.515

TPSA: 66.48

MolLogP: 4.148200000000003

Number of H-Donors: 3

Number of H-Acceptors: 3

RingCount: 0

Activities Information

Organism Target Name Standard Type Standard Value Standard Units doi
Anagnostidinema amphibium Anagnostidinema amphibium Activity nan None 10.1021/np970527y
Bacillus anthracis Anthrax lethal factor Potency 12589.3 nM None
Bacillus subtilis 4'-phosphopantetheinyl transferase ffp Potency 44668.4 nM None
Brachiomonas submarina Brachiomonas submarina Activity nan None 10.1021/np970527y
Candida albicans Candida albicans Activity nan None 10.1016/j.bmcl.2008.05.067
Candida albicans Candida albicans MFC 5.0 ug ml-1 10.1016/j.bmcl.2008.05.067
Chlorocebus sabaeus Vero IC50 25000.0 nM None
Homo sapiens Arachidonate 15-lipoxygenase, type II Potency 3162.3 nM None
Homo sapiens Ataxin-2 Potency 39810.7 nM None
Homo sapiens Beta-glucocerebrosidase Potency 17782.8 nM None
Homo sapiens Beta-glucocerebrosidase Potency 22387.2 nM None
Homo sapiens Cellular tumor antigen p53 Potency 31622.8 nM None
Homo sapiens Cholesteryl ester transfer protein IC50 12900.0 nM 10.1016/S0960-894X(97)00248-5
Homo sapiens Cytochrome P450 1A2 AC50 25118.86 nM None
Homo sapiens Cytochrome P450 2C19 AC50 nan None None
Homo sapiens Cytochrome P450 2C9 AC50 nan None None
Homo sapiens Cytochrome P450 2D6 AC50 7943.28 nM None
Homo sapiens Cytochrome P450 2D6 Potency 7943.3 nM None
Homo sapiens Cytochrome P450 3A4 AC50 31622.78 nM None
Homo sapiens Cytochrome P450 3A4 Potency 31622.8 nM None
Homo sapiens DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase Potency 63.1 nM None
Homo sapiens DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase Potency 19952.6 nM None
Homo sapiens Geminin Potency 29092.9 nM None
Homo sapiens HeLa GI50 15000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2015.03.046
Homo sapiens Histone acetyltransferase GCN5 Potency 28183.8 nM None
Homo sapiens Histone deacetylase 6 Inhibition 3.58 % 10.6019/CHEMBL4808148
Homo sapiens Histone deacetylase 6 Inhibition 25.96 % 10.6019/CHEMBL4808148
Homo sapiens Huntingtin Potency 25118.9 nM None
Homo sapiens Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic Potency 18356.4 nM None
Homo sapiens Jurkat IC50 3530.0 nM 10.1074/jbc.m609124200
Homo sapiens Jurkat IC50 3680.0 nM 10.1074/jbc.m609124200
Homo sapiens Jurkat IC50 4900.0 nM 10.1074/jbc.m609124200
Homo sapiens Jurkat IC50 6310.0 nM 10.1074/jbc.m609124200
Homo sapiens Jurkat Ratio IC50 1.3 None 10.1074/jbc.m609124200
Homo sapiens Jurkat Ratio IC50 1.4 None 10.1074/jbc.m609124200
Homo sapiens Jurkat Ratio IC50 1.8 None 10.1074/jbc.m609124200
Homo sapiens Lysine-specific demethylase 4D-like Potency 39810.7 nM None
Homo sapiens Microtubule-associated protein tau Potency 39810.7 nM None
Homo sapiens P-glycoprotein 1 Activity nan None 10.1271/bbb.68.2541
Homo sapiens Runt-related transcription factor 1/Core-binding factor subunit beta Potency 10000.0 nM None
Homo sapiens Runt-related transcription factor 1/Core-binding factor subunit beta Potency 31622.8 nM None
Homo sapiens Sphingomyelin phosphodiesterase Potency 89125.1 nM None
Homo sapiens SW1573 GI50 4500.0 nM 10.1016/j.ejmech.2015.03.046
Homo sapiens T47D GI50 22000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2015.03.046
Homo sapiens TAR DNA-binding protein 43 Potency 7079.5 nM None
Homo sapiens Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 Potency 0.6 nM None
Homo sapiens Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 Potency 11582.1 nM None
Homo sapiens Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 Potency 12995.3 nM None
Homo sapiens Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 Potency 16360.1 nM None
Homo sapiens Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 Potency 21136.0 nM None
Homo sapiens Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 Potency 23109.3 nM None
Homo sapiens Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1 Potency 31622.8 nM None
Homo sapiens Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N IC50 13378.0 nM None
Homo sapiens Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N IC50 15487.0 nM None
Homo sapiens Vitamin D receptor Potency 70794.6 nM None
Homo sapiens WiDr GI50 19000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2015.03.046
Mus musculus Bcl-2-related protein A1 IC50 20000.0 nM None
Mus musculus FL5.12 Activity 38.0 None 10.1016/j.bmc.2016.07.038
Mus musculus FL5.12 Activity 47.0 % 10.1016/j.bmc.2016.07.038
Mus musculus FL5.12 IC50 3500.0 nM 10.1016/j.bmc.2016.07.038
Mycobacterium tuberculosis Acyl-CoA synthase AC50 5600.0 nM None
Nakaseomyces glabratus Nakaseomyces glabratus MFC 1.0 ug ml-1 10.1016/j.bmcl.2008.05.067
Plasmodium falciparum Plasmodium falciparum IC50 10000.0 nM 10.1038/nchembio.215
Plasmodium falciparum Plasmodium falciparum IC50 12589.25 nM 10.1038/nchembio.215
Plasmodium falciparum Plasmodium falciparum Potency 13115.4 nM None
Prorocentrum micans Prorocentrum micans Activity nan None 10.1021/np970527y
Rattus norvegicus Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic Potency 100000.0 nM None
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 Replicase polyprotein 1ab Inhibition -7.653 % 10.6019/CHEMBL4495564
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 SARS-CoV-2 IC50 19952.62 nM 10.6019/CHEMBL4651402
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 SARS-CoV-2 IC50 20000.0 nM 10.6019/CHEMBL4651402
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 SARS-CoV-2 Inhibition -0.08 % 10.6019/CHEMBL4495565
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 SARS-CoV-2 Inhibition 0.09 % 10.21203/rs.3.rs-23951/v1
Streptococcus Streptococcus EC50 8911.0 nM None
Streptococcus pyogenes serotype M1 Streptokinase A EC50 2204.0 nM None
Streptococcus pyogenes serotype M1 Streptokinase A EC50 150000.0 nM None
Streptococcus sp. 'group A' Streptococcus sp. 'group A' EC50 1338.0 nM None
Trypanosoma cruzi Cruzipain Potency 17782.8 nM None
Trypanosoma cruzi Cruzipain Potency 39810.7 nM None
None Leukemia 60 cell line GC50 0.49 uM 10.1016/s0960-894x(99)00574-0
None Leukemia 60 cell line TC50 2.55 uM 10.1016/s0960-894x(99)00574-0
None NON-PROTEIN TARGET GI50 25000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2015.03.046
None Unchecked EC50 7582.0 nM None
None Unchecked EC50 8665.0 nM None
None Unchecked EC50 9930.0 nM None
None Unchecked EC50 14000.0 nM None
None Unchecked Inhibition nan % 10.1038/nchembio873
None Unchecked Potency 398.1 nM None
None Unchecked Potency 25118.9 nM None
None Unchecked Potency 28183.8 nM None
None Unchecked Potency 35481.3 nM None

Metabolism Information

AKRT ID Reaction Reaction Link ID
AKRT000139 *C(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO RXN-13733
AKRT000459 *C(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>*C(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC RXN-7792
AKRT004508 CC(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@H](CO)NC(C)=O 36719
AKRT007579 CCCCC/C=C\C/C=C\C/C=C\C/C=C\CCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO 45376
AKRT008143 CCCCCCCC/C=C/CCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO enzymemap_76976
AKRT008150 CCCCCCCC/C=C/CCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO enzymemap_76969
AKRT008178 CCCCCCCC/C=C\CCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO 45372
AKRT008383 CCCCCCCC/C=C\CCCCCCCC(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCC/C=C\CCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC 36575
AKRT008396 CCCCCCCC/C=C\CCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO 45360
AKRT008400 CCCCCCCC/C=C\CCCCCCCCCCCC(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCC/C=C\CCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC 64048
AKRT008414 CCCCCCCC/C=C\CCCCCCCCCCCCCC(=O)[32S].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCC/C=C\CCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC None
AKRT008417 CCCCCCCC/C=C\CCCCCCCCCCCCCC(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCC/C=C\CCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC 36667
AKRT008419 CCCCCCCC/C=C\CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCC/C=C\CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC 36671
AKRT008675 CCCCCCCCCCCCC/C=C/[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO MNXR191195
AKRT008872 CCCCCCCCCCCCCC(=O)[32S].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@H](CO)NC(=O)CCCCCCCCCCCCC None
AKRT008877 CCCCCCCCCCCCCC(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@H](CO)NC(=O)CCCCCCCCCCCCC 36571
AKRT008892 CCCCCCCCCCCCCCC(O)C(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@H](CO)NC(=O)C(O)CCCCCCCCCCCCCC 36647
AKRT008894 CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)C(N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO enzymemap_678
AKRT008912 CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO enzymemap_76927
AKRT008920 CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)O.CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC 43440
AKRT009037 CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)[32S].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC None
AKRT009046 CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO 3-DEHYDROSPHINGANINE-REDUCTASE-RXN
AKRT009056 CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC RXN-20367
AKRT009080 CCCCCCCCCCCCCCCCC(O)C(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCCC(O)C(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC 36615
AKRT009087 CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO 45008
AKRT009155 CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)[32S].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC None
AKRT009159 CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC RXN-20366
AKRT009185 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC 36555
AKRT009192 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)C(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)C(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC 36619
AKRT009201 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)[32S].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC None
AKRT009202 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC 36535
AKRT009207 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)C(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)C(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC 36627
AKRT009211 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO 33843
AKRT009217 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)[32S].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC None
AKRT009219 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC 33591
AKRT009223 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)C(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)C(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC 33491
AKRT009228 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC 33351
AKRT009232 CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)[CoA].CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)CCCCCCCCCCCCCCC 36675
AKRT009273 CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO.Nc1ncnc2c1ncn2[C@@H]1O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)[C@@H](O)[C@H]1O>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)COP(=O)(O)O.Nc1ncnc2c1ncn2[C@@H]1O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)O)[C@@H](O)[C@H]1O None
AKRT009274 CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO.O=C(O)CCCCCCCCCCCNc1ccc([N+](=O)[O-])c2nonc12>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@H](CO)NC(=O)CCCCCCCCCCCNc1ccc([N+](=O)[O-])c2nonc12 enzymemap_76910
AKRT009275 CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO.O=C([CoA])CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCO>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@H](CO)NC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCO RXN-20387
AKRT009276 CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO.O=c1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]3O)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)[nH]1>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O enzymemap_38037
AKRT009277 CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO.O=c1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]3O)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)[nH]1>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O 43408
AKRT009278 CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)COP(=O)(O)O SPHINGANINE-KINASE-RXN
AKRT009279 CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO>>CCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](N)CO R06525
AKRT009282 CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)COP(=O)(O)O>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO DHS-PHOSPHATASE-RXN
AKRT009287 CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@H](CO)NC(=O)CCCCC>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO 38887
AKRT009289 CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@H](CO)NC(=O)CCCCCCC>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO MNXR129591
AKRT009290 CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@H](CO)NC(=O)CCCCCCCCCCC>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO 45448
AKRT009291 CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@H](CO)NC(=O)CCCCCCCCCCCNc1ccc([N+](=O)[O-])c2nonc12>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO enzymemap_76910
AKRT009294 CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@H](CO)NC(C)=O>>CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](N)CO 33551