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name Structure Reference Source Properties Activities Metabolism

1,4-Dideoxy-1,4-imino-D-arabinitol

AlkaPlorer ID: AK009326

Synonym: 'D-AB1'

IUPAC Name: (2R,3R,4R)-2-(hydroxymethyl)pyrrolidin-1-ium-3,4-diol

Structure

SMILES: OC[C@H]1[NH2+]C[C@@H](O)[C@@H]1O

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InChI: InChI=1S/C5H11NO3/c7-2-3-5(9)4(8)1-6-3/h3-9H,1-2H2/p+1/t3-,4-,5-/m1/s1

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InChIKey: OQEBIHBLFRADNM-UOWFLXDJSA-O

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Properties Information

Molecule Weight: 134.155

TPSA？: 77.30000000000001

MolLogP？: -3.353899999999998

Number of H-Donors: 4

Number of H-Acceptors: 3

RingCount: 1

Activities Information

Organism Target Name Standard Type Standard Value Standard Units doi
Bos taurus Alpha-L-fucosidase 1 IC50 nan None 10.1016/j.ejmech.2022.114230
Bos taurus Alpha-L-fucosidase 1 Inhibition 9.0 % 10.1016/j.ejmech.2022.114499
Bos taurus Alpha-L-fucosidase 1 Inhibition 50.0 % 10.1016/j.ejmech.2020.112034
Bos taurus Alpha-L-fucosidase 1 Inhibition 50.0 % 10.1021/np010360f
Bos taurus Beta-galactosidase Inhibition 50.0 % 10.1021/np010360f
Canavalia ensiformis Alpha-mannosidase IC50 320000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114230
Canavalia ensiformis Alpha-mannosidase IC50 474000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114499
Canavalia ensiformis Alpha-mannosidase Inhibition 50.0 % 10.1016/j.ejmech.2020.112034
Canavalia ensiformis Alpha-mannosidase Inhibition nan % 10.1016/j.ejmech.2015.08.038
Coffea arabica Alpha-galactosidase Inhibition 4.1 % 10.1016/j.ejmech.2022.114499
Coffea arabica Alpha-galactosidase Inhibition 50.0 % 10.1016/j.ejmech.2022.114230
Coffea arabica Alpha-galactosidase Inhibition 50.0 % 10.1021/np010360f
Coffea arabica Alpha-galactosidase Inhibition nan % 10.1016/j.ejmech.2015.08.038
Escherichia coli K-12 Beta-galactosidase Inhibition nan % 10.1016/j.ejmech.2015.08.038
Homo sapiens Beta-glucosidase IC50 120000.0 nM 10.1016/j.bmc.2008.01.032
Homo sapiens Geminin Potency 1258.9 nM None
Homo sapiens Glycogen debranching enzyme IC50 8400.0 nM 10.1016/j.bmc.2008.01.032
Homo sapiens Glycogen debranching enzyme IC50 8400.0 nM 10.1016/j.bmc.2008.06.026
Homo sapiens GTP-binding nuclear protein Ran/Importin subunit beta-1/Snurportin-1 Potency 562.3 nM None
Homo sapiens HEK293 Potency 5802.4 nM None
Homo sapiens Liver glycogen phosphorylase Ki 400.0 nM 10.1021/jm031121n
Homo sapiens Lysosomal alpha-glucosidase Delta Tm 0.0 degrees C 10.1016/j.bmc.2022.117129
Homo sapiens Lysosomal alpha-glucosidase Delta Tm 4.1 degrees C 10.1016/j.bmc.2022.117129
Homo sapiens Lysosomal alpha-glucosidase Delta Tm 10.8 degrees C 10.1016/j.bmc.2022.117129
Homo sapiens Lysosomal alpha-glucosidase IC50 nan None 10.1016/j.ejmech.2022.114230
Homo sapiens Lysosomal alpha-glucosidase Ki 115000.0 nM 10.1016/j.bmc.2022.117129
Homo sapiens Maltase-glucoamylase IC50 55000.0 nM 10.1021/jm00013a012
Homo sapiens Maltase-glucoamylase IC50 56000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114499
Homo sapiens MOLT-4 CC50 100000.0 ug.mL-1 10.1021/jm00013a012
Homo sapiens MOLT-4 EC50 100000.0 ug.mL-1 10.1021/jm00013a012
Homo sapiens MT4 CC50 100000.0 ug.mL-1 10.1021/jm00013a012
Homo sapiens MT4 EC50 100000.0 ug.mL-1 10.1021/jm00013a012
Homo sapiens TAR DNA-binding protein 43 Potency 35481.3 nM None
Macaca fascicularis Cynomolgus monkey AUC 9.66 ng.hr.mL-1 10.1124/dmd.112.050591
Macaca fascicularis Cynomolgus monkey AUC 40.2 ng.hr.mL-1 10.1124/dmd.112.050591
Macaca fascicularis Cynomolgus monkey AUC 146.0 ng.hr.mL-1 10.1124/dmd.112.050591
Macaca fascicularis Cynomolgus monkey Cmax 10.51 nM 10.1124/dmd.112.050591
Macaca fascicularis Cynomolgus monkey Cmax 36.5 nM 10.1124/dmd.112.050591
Macaca fascicularis Cynomolgus monkey Cmax 155.46 nM 10.1124/dmd.112.050591
Macaca fascicularis Cynomolgus monkey Drug uptake 60.8 % 10.1124/dmd.112.050591
Macaca fascicularis Cynomolgus monkey Drug uptake 62.5 % 10.1124/dmd.112.050591
Macaca fascicularis Cynomolgus monkey Drug uptake 83.5 % 10.1124/dmd.112.050591
Macaca fascicularis Cynomolgus monkey Tmax 1.25 hr 10.1124/dmd.112.050591
Macaca fascicularis Cynomolgus monkey Tmax 1.75 hr 10.1124/dmd.112.050591
Macaca fascicularis Cynomolgus monkey Tmax 3.5 hr 10.1124/dmd.112.050591
Mus musculus Mus musculus Ki 392.0 nM 10.1124/dmd.112.050591
Oryctolagus cuniculus Glycogen phosphorylase, muscle form Ki 400.0 nM 10.1016/j.ejmech.2015.12.004
Plasmodium falciparum Plasmodium falciparum Potency 65.7 nM None
Rattus norvegicus Acidic alpha-glucosidase IC50 15000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114499
Rattus norvegicus Acidic alpha-glucosidase IC50 55000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114230
Rattus norvegicus Acidic alpha-glucosidase IC50 55000.0 nM 10.1021/np010360f
Rattus norvegicus Alpha-mannosidase 2C1 IC50 50000.0 nM 10.1021/jm00013a012
Rattus norvegicus Alpha-mannosidase 2C1 IC50 100000.0 nM 10.1021/jm00129a011
Rattus norvegicus Beta-mannosidase IC50 290000.0 nM 10.1021/np010360f
Rattus norvegicus Hepatocyte IC50 1000.0 nM 10.1016/j.bmc.2008.01.032
Rattus norvegicus Hepatocyte IC50 1000.0 nM 10.1016/j.bmc.2008.06.026
Rattus norvegicus Hepatocyte IC50 9000.0 nM 10.1016/j.bmc.2008.06.026
Rattus norvegicus Intestine Drug metabolism nan None 10.1124/dmd.112.050617
Rattus norvegicus Intestine Drug uptake 1.0 % 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Lactase-glycosylceramidase IC50 260000.0 nM 10.1021/jm00013a012
Rattus norvegicus Liver glycogen phosphorylase IC50 1000.0 nM 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Liver glycogen phosphorylase IC50 1100.0 nM 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Mannosidase 2 alpha 1 IC50 46000.0 nM 10.1021/jm00013a012
Rattus norvegicus Mannosidase 2 alpha 1 Ki 35000.0 nM 10.1021/jm00013a012
Rattus norvegicus Mannosidase 2, alpha B1 IC50 110000.0 nM 10.1021/jm00013a012
Rattus norvegicus Plasma Drug metabolism nan None 10.1124/dmd.112.050617
Rattus norvegicus Rattus norvegicus AUC 0.387 ng.hr.mL-1 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus AUC 2.64 ng.hr.mL-1 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus AUC 2.82 ng.hr.mL-1 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus AUC 26.1 ng.hr.mL-1 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus AUC 49.2 ng.hr.mL-1 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus AUC 103.0 ng.hr.mL-1 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus CL 25.0 mL.min-1.kg-1 10.1124/dmd.112.050617
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Cmax 5.813 nM 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Cmax 12.84 nM 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Cmax 20.05 nM 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Cmax 79.61 nM 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Cmax 156.97 nM 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Cmax 298.91 nM 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Cmax 300.0 nM 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Drug uptake 0.00672 % 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Drug uptake 0.0172 % 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Drug uptake 22.1 % 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Drug uptake 32.2 % 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Drug uptake 49.9 % 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Drug uptake 73.4 % 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus F 89.0 % 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus F 89.0 % 10.1124/dmd.112.050617
Rattus norvegicus Rattus norvegicus T1/2 0.8 hr 10.1124/dmd.112.050617
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Tmax 0.125 hr 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Tmax 0.354 hr 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Tmax 0.688 hr 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Tmax 0.938 hr 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Tmax 1.25 hr 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Rattus norvegicus Tmax 1.33 hr 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Stomach Drug uptake 1.0 % 10.1124/dmd.112.050591
Rattus norvegicus Sucrase-isomaltase IC50 3100.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114499
Rattus norvegicus Sucrase-isomaltase IC50 5800.0 nM 10.1016/j.bmc.2008.01.032
Rattus norvegicus Sucrase-isomaltase IC50 5800.0 nM 10.1021/jm00013a012
Rattus norvegicus Sucrase-isomaltase IC50 5800.0 nM 10.1021/np010360f
Rattus norvegicus Sucrase-isomaltase IC50 16000.0 nM 10.1016/j.bmc.2008.01.032
Rattus norvegicus Sucrase-isomaltase IC50 16000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114230
Rattus norvegicus Sucrase-isomaltase IC50 16000.0 nM 10.1021/jm00013a012
Rattus norvegicus Sucrase-isomaltase IC50 16000.0 nM 10.1021/np010360f
Rattus norvegicus Sucrase-isomaltase IC50 55000.0 nM 10.1016/j.bmc.2008.01.032
Rattus norvegicus Trehalase IC50 25000.0 nM 10.1021/jm00013a012
Saccharomyces cerevisiae Alpha-glucosidase MAL62 IC50 840.0 nM 10.1021/np010360f
Saccharomyces cerevisiae Saccharomyces cerevisiae Potency 6513.1 nM None
Saccharomyces cerevisiae S288c Glucoamylase, intracellular sporulation-specific IC50 150.0 nM 10.1016/j.bmc.2007.03.073
Sus scrofa Uncharacterized protein IC50 2500.0 nM 10.1021/np010360f
None ADMET Compound recovery 5.3 % 10.1124/dmd.112.050617
None ADMET Drug excretion 2.2 % 10.1124/dmd.112.050591
None ADMET Drug excretion 5.3 % 10.1124/dmd.112.050591
None ADMET Drug excretion 9.7 % 10.1124/dmd.112.050591
None ADMET Drug metabolism nan None 10.1124/dmd.112.050591
None ADMET Drug uptake 7.1 % 10.1124/dmd.112.050591
None ADMET Drug uptake nan None 10.1124/dmd.112.050591
None Unchecked Activity nan None 10.1021/np50098a020
None Unchecked IC50 0.16 ug.mL-1 10.1021/np060551o
None Unchecked IC50 110.0 nM 10.1021/np010360f
None Unchecked IC50 150.0 nM 10.1016/j.ejmech.2020.112034
None Unchecked IC50 150.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114230
None Unchecked IC50 180.0 nM 10.1016/j.bmc.2008.01.032
None Unchecked IC50 430.0 nM 10.1016/j.bmc.2008.01.032
None Unchecked IC50 1200.0 nM 10.1021/np010360f
None Unchecked IC50 2500.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114499
None Unchecked IC50 4800.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114230
None Unchecked IC50 5800.0 nM 10.1016/j.ejmech.2020.112034
None Unchecked IC50 11000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114499
None Unchecked IC50 20000.0 nM 10.1021/jm00013a012
None Unchecked IC50 50000.0 nM 10.1021/jm00013a012
None Unchecked IC50 55000.0 nM 10.1021/acs.jmedchem.1c01673
None Unchecked IC50 58010.0 nM 10.1016/j.ejmech.2020.112034
None Unchecked IC50 87000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114499
None Unchecked IC50 120000.0 nM 10.1021/np010360f
None Unchecked IC50 130000.0 nM 10.1021/jm00013a012
None Unchecked IC50 150000.0 nM 10.1021/np010360f
None Unchecked IC50 200000.0 nM 10.1016/j.bmc.2007.03.073
None Unchecked IC50 250000.0 nM 10.1016/j.bmc.2008.01.032
None Unchecked IC50 250000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114230
None Unchecked IC50 340000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114499
None Unchecked IC50 355000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114499
None Unchecked IC50 362000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114230
None Unchecked IC50 400000.0 nM 10.1021/np010360f
None Unchecked IC50 500000.0 nM 10.1016/j.bmc.2007.03.073
None Unchecked IC50 638000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114230
None Unchecked IC50 900000.0 nM 10.1016/j.bmc.2008.01.032
None Unchecked IC50 967000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2022.114499
None Unchecked IC50 nan None 10.1016/j.ejmech.2022.114230
None Unchecked Inhibition 5.3 % 10.1016/j.ejmech.2022.114499
None Unchecked Inhibition 6.3 % 10.1016/j.ejmech.2022.114499
None Unchecked Inhibition 7.9 % 10.1016/j.ejmech.2022.114499
None Unchecked Inhibition 11.4 % 10.1016/j.ejmech.2022.114499
None Unchecked Inhibition 13.0 % 10.1016/j.ejmech.2022.114499
None Unchecked Inhibition 13.5 % 10.1016/j.ejmech.2022.114499
None Unchecked Inhibition 50.0 % 10.1016/j.ejmech.2022.114230
None Unchecked Inhibition nan % 10.1016/j.ejmech.2015.08.038
None Unchecked Inhibition nan % 10.1038/nchembio873
None Unchecked Ki 170.0 nM 10.1016/j.ejmech.2015.08.038
None Unchecked Ki 4400.0 nM 10.1016/j.ejmech.2015.08.038
None Unchecked Ki 5900.0 nM 10.1016/j.ejmech.2015.08.038
None Unchecked Ki 9700.0 nM 10.1021/jm00013a012
None Unchecked Ki 35000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2015.08.038
None Unchecked Ki 572000.0 nM 10.1016/j.ejmech.2015.08.038

Metabolism Information