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name Structure Reference Source Properties Activities Metabolism

dTDP(3-)

AlkaPlorer ID: AK017200

Synonym: "THYMIDINE-5'- DIPHOSPHATE", "Thymidine 5'-diphosphate", 'deoxy-TDP', 'dTDP trianion', "Deoxythymidine 5'-diphosphate", "2'-deoxyribosylthymine 5'-(trihydrogen diphosphate)", "thymidine 5'-pyrophosphate(3-)", "thymidine 5'-diphosphate", 'dTDP', "thymidine 5'-pyrophosphate trianion", "thymidine 5'-diphosphate trianion", "thymidine 5'-diphosphate(3-)", "thymidine 5'-pyrophosphate"

IUPAC Name: [(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate

Structure

SMILES: CC1=CN([C@H]2C[C@H](O)[C@@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O2)C(=O)NC1=O

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InChI: InChI=1S/C10H16N2O11P2/c1-5-3-12(10(15)11-9(5)14)8-2-6(13)7(22-8)4-21-25(19,20)23-24(16,17)18/h3,6-8,13H,2,4H2,1H3,(H,19,20)(H,11,14,15)(H2,16,17,18)/t6-,7+,8+/m0/s1

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InChIKey: UJLXYODCHAELLY-XLPZGREQSA-N

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Source

Species Genus Family Order Class Phylum Kingdom Domain
Escherichia coli Escherichia Enterobacteriaceae Enterobacterales Gammaproteobacteria Pseudomonadota None Bacteria

Properties Information

Molecule Weight: 402.1890000000001

TPSA？: 197.61

MolLogP？: -1.2802800000000003

Number of H-Donors: 5

Number of H-Acceptors: 9

RingCount: 2

Activities Information

Organism Target Name Standard Type Standard Value Standard Units doi
Homo sapiens Nucleoside diphosphate kinase 1 Activity 1.3 uM 10.1128/aac.01432-06
Homo sapiens Nucleoside diphosphate kinase 1 Activity 1000.0 nmol 10.1128/aac.01432-06
Homo sapiens Nucleoside diphosphate kinase 1 Activity 89000.0 % 10.1128/aac.01432-06
Homo sapiens Nucleoside diphosphate kinase 2 Activity 1.4 uM 10.1128/aac.01432-06
Homo sapiens Nucleoside diphosphate kinase 2 Activity 1000.0 nmol 10.1128/aac.01432-06
Homo sapiens Nucleoside diphosphate kinase 2 Activity 83000.0 % 10.1128/aac.01432-06
None Unchecked Activity 0.049 nmol 10.1128/aac.01432-06
None Unchecked Activity 2.0 nmol 10.1128/aac.01432-06
None Unchecked Activity 21.0 nmol/min/mg 10.1128/aac.01432-06
None Unchecked Activity 137.0 nmol/min/mg 10.1128/aac.01432-06
None Unchecked Activity 490.0 % 10.1128/aac.01432-06
None Unchecked Activity 1100.0 nmol 10.1128/aac.01432-06
None Unchecked Activity 1300.0 % 10.1128/aac.01432-06
None Unchecked Activity 2700.0 nmol/min/mg 10.1128/aac.01432-06
None Unchecked Activity 260000.0 % 10.1128/aac.01432-06
None Unchecked Activity nan None 10.1128/aac.01432-06

Metabolism Information

AKRT ID Reaction Reaction Link ID
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