Gentamicin A

AlkaPlorer ID: AK034835

Synonym: None

IUPAC Name: (2R,3S,4R,5R,6S)-5-amino-6-[(1R,2S,3S,4R,6S)-4,6-diamino-3-[(2R,3R,4S,5S)-3,5-dihydroxy-4-(methylamino)oxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxy-2-(hydroxymethyl)oxane-3,4-diol

Structure

SMILES: CN[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H](O)[C@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]3N)[C@@H](N)C[C@H]2N)OC[C@H]1O

copy

InChI: InChI=1S/C18H36N4O10/c1-22-10-7(24)4-29-18(13(10)27)32-16-6(20)2-5(19)15(14(16)28)31-17-9(21)12(26)11(25)8(3-23)30-17/h5-18,22-28H,2-4,19-21H2,1H3/t5-,6+,7+,8+,9+,10-,11+,12+,13+,14-,15+,16-,17+,18+/m0/s1

copy

InChIKey: LKKVGKXCMYHKSL-QVNYEEQUSA-N

copy

Reference

None

PubChem CID: 12810388

CAS: 13291-74-2

SuperNatural Ⅲ: SN0207927-05

NPASS: NPC302103

{

NPAtlas: NPA001612

Properties Information

Molecule Weight: 468.5040000000002

TPSA: 248.39

MolLogP: -6.391600000000005

Number of H-Donors: 10

Number of H-Acceptors: 14

RingCount: 3

Activities Information

Organism Target Name Standard Type Standard Value Standard Units doi

Metabolism Information

AKRT ID Reaction Reaction Link ID
AKRT010938 CN[C@H]1[C@H](O)CO[C@H](O[C@@H]2[C@@H](O)[C@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]3N)[C@@H](N)C[C@H]2N)[C@@H]1O.C[SAH]>>CN[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H](O)[C@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]3N)[C@@H](N)C[C@H]2N)OC[C@]1(C)O RXN-13234
AKRT010939 CN[C@H]1[C@H](O)CO[C@H](O[C@@H]2[C@@H](O)[C@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]3N)[C@@H](N)C[C@H]2N)[C@@H]1O.Nc1ncnc2c1ncn2[C@@H]1O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)[C@@H](O)[C@H]1O>>CN[C@H]1[C@H](O)CO[C@H](O[C@@H]2[C@@H](O)[C@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]3N)[C@@H](N)C[C@H]2N)[C@@H]1OP(=O)(O)OC[C@H]1O[C@@H](n2cnc3c(N)ncnc32)[C@H](O)[C@@H]1O enzymemap_48895
AKRT010940 CN[C@H]1[C@H](O)CO[C@H](O[C@@H]2[C@@H](O)[C@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]3N)[C@@H](N)C[C@H]2N)[C@@H]1OP(=O)(O)OC[C@H]1O[C@@H](n2cnc3c(N)ncnc32)[C@H](O)[C@@H]1O>>CN[C@H]1[C@H](O)CO[C@H](O[C@@H]2[C@@H](O)[C@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]3N)[C@@H](N)C[C@H]2N)[C@@H]1O enzymemap_48895
AKRT010942 CN[C@H]1[C@H](O)CO[C@H](O[C@H]2[C@H](N)C[C@H](N)[C@@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]3N)[C@@H]2O)[C@@H]1O>>CN[C@H]1[C@H](O)CO[C@H](O[C@H]2[C@H](N)C[C@H](N)[C@@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]3N)[C@@H]2O)[C@@H]1OP(=O)(O)O RXN-16728
AKRT014693 C[SAH].N[C@H]1C[C@@H](N)[C@H](O[C@H]2OC[C@@H](O)[C@H](N)[C@H]2O)[C@@H](O)[C@@H]1O[C@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1N>>CN[C@H]1[C@H](O)CO[C@H](O[C@@H]2[C@@H](O)[C@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]3N)[C@@H](N)C[C@H]2N)[C@@H]1O R11292
AKRT014694 C[SAH].N[C@H]1C[C@@H](N)[C@H](O[C@H]2OC[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]2O)[C@@H](O)[C@@H]1O[C@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1N>>CN[C@H]1[C@H](O)CO[C@H](O[C@@H]2[C@@H](O)[C@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]3N)[C@@H](N)C[C@H]2N)[C@@H]1O RXN-13233