Molecule

Cytidine diphosphate ribitol

AlkaPlorer ID: AK047347

Synonym: None

IUPAC Name: [[(2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] [(2R,3S,4S)-2,3,4,5-tetrahydroxypentyl] hydrogen phosphate

Structure

SMILES: N=C1C=CN([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)C(O)=N1

InChI: InChI=1S/C14H25N3O15P2/c15-9-1-2-17(14(24)16-9)13-12(23)11(22)8(31-13)5-30-34(27,28)32-33(25,26)29-4-7(20)10(21)6(19)3-18/h1-2,6-8,10-13,18-23H,3-5H2,(H,25,26)(H,27,28)(H2,15,16,24)/t6-,7+,8+,10-,11+,12+,13+/m0/s1

InChIKey: DPJKHFICSGCNIR-HRENORGGSA-N

Reference

The isolation with cytidine diphosphate glycerol, cytidine diphosphate ribitol and mannitol 1-phosphate from <i>Lactobacillus arabinosus</i>

PubChem CID: 165130

CAS: 3506-17-0

SuperNatural Ⅲ: SN0071892-01

NPASS: NPC126704

{

NPAtlas: NPA006986

Source

Species	Genus	Family	Order	Class	Phylum	Kingdom	Domain
Zanthoxylum flavum	Zanthoxylum	Rutaceae	Sapindales	Magnoliopsida	Streptophyta	Viridiplantae	Eukaryota
Gelsemium rankinii	Gelsemium	Gelsemiaceae	Gentianales	Magnoliopsida	Streptophyta	Viridiplantae	Eukaryota
None	Lactobacillus	Lactobacillaceae	Lactobacillales	Bacilli	Bacillota	None	Bacteria
Inonotus obliquus	Inonotus	Hymenochaetaceae	Hymenochaetales	Agaricomycetes	Basidiomycota	Fungi	Eukaryota

Properties Information

Molecule Weight: 537.3080000000001

TPSA？: 294.79999999999995

MolLogP？: -3.98703

Number of H-Donors: 10

Number of H-Acceptors: 16

RingCount: 2

Activities Information

Organism	Target Name	Standard Type	Standard Value	Standard Units	doi

Metabolism Information

AKRT ID	Reaction	Reaction Link ID
AKRT000769	N[C@H](C()=O)[C@H]()O[C@H]1O[C@H](COP(=O)(O)O)[C@@H](O[C@@H]2O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]3O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]3NC(C)=O)[C@H]2NC(C)=O)[C@H](O)[C@@H]1O.Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1>>N[C@H](C()=O)[C@H]()O[C@H]1O[C@H](COP(=O)(O)O)[C@@H](O[C@@H]2O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]3O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@H]3NC(C)=O)[C@H]2NC(C)=O)[C@H](O)[C@@H]1O	RXN-19400
AKRT000770	N[C@H](C()=O)[C@H]()O[C@H]1O[C@H](COP(=O)(O)O)[C@@H](O[C@@H]2O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]3O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@H]3NC(C)=O)[C@H]2NC(C)=O)[C@H](O)[C@@H]1O.Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1>>N[C@H](C()=O)[C@H]()O[C@H]1O[C@H](COP(=O)(O)O)[C@@H](O[C@@H]2O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]3O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)COP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@H]3NC(C)=O)[C@H]2NC(C)=O)[C@H](O)[C@@H]1O	RXN-19401
AKRT000771	N[C@H](C()=O)[C@H](*)O[C@H]1O[C@H](COP(=O)(O)O)[C@@H](O[C@@H]2O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]3O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)COP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@H]3NC(C)=O)[C@H]2NC(C)=O)[C@H](O)[C@@H]1O.Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)O)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1>>Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1	MNXR183987
AKRT003895	CC(=O)N[C@H]1[C@H](OP(=O)(O)OP(=O)(O)OC/C=C(/C)CC/C=C(/C)CC/C=C(/C)CC/C=C(/C)CC/C=C(/C)CC/C=C(/C)CC/C=C(/C)CC/C=C(/C)CC/C=C(\C)CC/C=C(\C)CCC=C(C)C)O[C@H](C)[C@H](N)[C@@H]1O[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O.Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1>>CC(=O)N[C@H]1[C@H](OP(=O)(O)OP(=O)(O)OC/C=C(/C)CC/C=C(/C)CC/C=C(/C)CC/C=C(/C)CC/C=C(/C)CC/C=C(/C)CC/C=C(/C)CC/C=C(/C)CC/C=C(\C)CC/C=C(\C)CCC=C(C)C)O[C@H](C)[C@H](N)[C@@H]1O[C@@H]1O[C@H](COP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O	RXN-18043
AKRT020890	Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1>>Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)O)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1	RXN-19400
AKRT020891	Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1>>Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1	R02921
AKRT020892	Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1>>Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1.O=P(O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO	None
AKRT020893	Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1>>O=P(O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO	R02921
AKRT020940	Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1.O=P(O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO>>Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1	2.7.7.40-RXN